Sur l\'île de Hachijojima, Tokyo, une équipe internationale d?ingénieurs est réunie pour une opération à grande échelle au sein de \"La bouée du Pacifique\", une installation en mer permettant de relier entre elles les caméras de sécurité des polices du monde entier. Pendant ce temps, Conan qui visite l?île avec les Détectives Juniors apprend qu?une employée d?Europol a été assassinée en Allemagne l?Organisation des Hommes en Noir. Inquiet, Conan se faufile dans la bouée du Pacifique et découvre qu\'une femme ingénieur a été kidnappée par l\'Organisation. Un grincement lugubre résonne à travers les fonds marins tandis qu?une ombre noire plane sur Ai Haibara?

Le quartier de Shibuya à Tokyo bat son plein pour la saison d'Halloween. La détective Miwako Sato est en robe de mariée devant un parterre d?invités, dont Conan bien sûr ! Soudain, un agresseur fait irruption dans la salle de réception et le détective Wataru Takagi, est blessé en tentant de protéger Sato. L?image de la Faucheuse qu?elle avait alors vue au-dessus du détective Matsuda plane désormais sur Takagi. Au même moment, voilà que l'auteur de l?explosion responsable de la mort de Matsuda s'évade de prison. Piégé par une mystérieuse personne déguisée, le détective Rei Furuya se retrouve avec une bombe autour du cou. Conan le retrouve dans l'abri souterrain où il se cache pour essayer de désarmer la bombe et là, ce dernier lui raconte les détails d'un incident ayant impliqué ses camarades de classe de l'académie de police : 3 ans plus tôt, ils ont rencontré un poseur de bombes nommé «Plamya» à Shibuya.

Le monde est en grand danger ! Considérant les Alters comme un fléau, l?organisation Humarise a décidé d?éradiquer les détenteurs de ces pouvoirs de la surface du globe. Pour ce faire, elle a placé des bombes exacerbant les Alters, jusqu?à en tuer leurs possesseurs. Tous les super-héros et les apprentis de Yuei sont envoyés à travers le monde pour éviter la catastrophe. Alors que Deku, Katsuki et Shoto suivent Endeavor pour endiguer la menace, Deku se retrouve accidentellement impliqué dans un incident et activement recherché par les autorités. Mais l?horloge tourne et ils n?ont que deux heures avant que ne se produise le pire. Face à un péril d?une ampleur sans précédent, le sort du monde et celui des héros repose désormais entre leurs mains !

Misato et son groupe anti-NERV, Wille, arrivent à Paris rougie par la core-ization. L\'équipage du vaisseau Wunder atterrit sur une tour de confinement. Ils ont 720 secondes pour remettre la ville sur pied. Une horde de NERV Evas apparaît et l\'Unité Eva 8 améliorée de Mari doit l\'intercepter. Entretemps, Shinji, Asuka et Rei flânent au Japon.

Le Japon se prépare à accueillir les Jeux Sportifs Mondiaux (JSM) à Tokyo. Le tout nouveau train à très grande vitesse Hyper Linear « Japanese Bullet » est le premier au monde à opérer dans un tunnel sous vide. Ce bijou de la technologie japonaise, capable d?atteindre 1000KM/h, sera inauguré à l?ouverture des JSM. Lors d?une fête organisée pour les sponsors des jeux, d?étranges incidents ont lieu, puis des personnalités sont kidnappées. Conan enquête et trouve un lien potentiel avec les kidnappings qui ont eu lieu aux JSM de Boston 15 ans auparavant.

L\'histoire du nouveau film se déroule dans la forêt d\'Okoya, un paradis Pokémon protégé par des règles strictes qui interdisent aux étrangers de mettre le pied à l\'intérieur. Le film se concentre sur Coco, un garçon qui a été élevé par Pokémon et se considère également comme un, traitant le Pokémon Mythique Zarude comme son père. Sasha et Pikachu rencontrent Coco lors d\'une aventure.

A Singapour, Conan enquête sur un meurtre perpétré dans un hôtel de luxe. Les premières pistes mènent alors le détective sur les traces du Blue Sapphire, un joyau disparu au fond de l\'océan durant 19ème siècle lors d\'un tragique naufrage.

Chaque année, à Fuura City, se tient un festival du vent. D\'anciennes légendes disent que, le dernier jour de ce festival, le pokémon légendaire Lugia ferait son apparition. De nombreuses personnes participent au festival cette année : Lisa, une lycéenne qui débute en pokémon, Kagachi, un homme vantard qui ne peut s\'empêcher de mentir, Torito un chercheur qui manque de confiance en lui, Hisui une vieille femme excentrique qui déteste les Pokémon et Largo, une fille mystérieuse qui se promène seule en forêt.

Ce film d?animation inédit vous dévoile pour la première fois les origines de la rencontre entre les légendaires Sacha & Pikachu et vous fait vivre leurs aventures trépidantes dans la quête de mettre la main sur le mystérieux Pokémon Ho-Oh. Le duo évolue autour des personnages emblématiques de la franchise, mais le film vous fait découvrir de nouveaux personnages, Trainers Verity et Sorrel, et même un étrange Pokémon qui répond au nom de Marshadow. Des défis hors du commun et des batailles épiques entre Pokémon foisonnent dans cette histoire unique portée par l?une des amitiés les plus aimées de la culture populaire, celle de l?intrépide Sacha et de l?énigmatique Pikachu.

Chaque année, à Fuura City, se tient un festival du vent. D\'anciennes légendes disent que, le dernier jour de ce festival, le pokémon légendaire Lugia ferait son apparition. De nombreuses personnes participent au festival cette année : Lisa, une lycéenne qui débute en pokémon, Kagachi, un homme vantard qui ne peut s\'empêcher de mentir, Torito un chercheur qui manque de confiance en lui, Hisui une vieille femme excentrique qui déteste les Pokémon et Largo, une fille mystérieuse qui se promène seule en forêt.